肝内胆管结石亦即肝内胆管结石，是指肝管分叉部以上原发性肝管结石，绝大多数是以胆红素钙为主要成分的色素性结石。虽然肝内胆管结石属原发型胆管结石的一部分，一般特指始发于肝内胆管系统的结石，一般不包括胆囊排出并上移至肝内胆管的结石，也不包括继发于损伤性胆管狭窄、胆管囊肿等胆道疾病所致的肝胆管结石。
那么，结石为什么会出现在肝内呢？
肝内胆管结石的主要致石因素为胆道感染和胆汁停滞，但由于肝内胆管系统的特有的解剖生理学因素，故肝内胆管结石的形成亦有一些特殊之处。
胆道感染常由多种细菌所致，并且大多数是与厌氧菌混合感染(19%～82%)。肝胆管内结石患者的胆汁细菌计数，虽然在无急性发作的情况下，亦往往超过10/ml，故胆汁中细菌的密度很高，在经受一些处理如穿刺、造影或手术等情况下，很容易诱发急性胆管炎。
胆道内色素性结石的形成,除了葡萄糖醛酸苷酶将结合胆红素水解生成游离的胆红素之外，尚与胆汁中存在的大分子物质如粘蛋白、酸性粘多糖和免疫球蛋白等所起着的纠缠、凝结、聚集的作用有关。胆道感染与肝内胆管结石形成间的关系虽然已得到确认，胆感染的细菌从何而来，亦即是感染的途径问题未有一致的认识。感染的途径可能有：细菌经门静脉血流至肝脏排至胆道内。
上行性胆道感染当有Oddi括约肌功能障碍时，肠道内细菌可通过括约肌反流入胆道内。
胆道奇生虫病在引起肝内胆管结石的重要性上已经得到确认。常见的有中华分支睾肝吸虫和蛔虫。在泰国，胆管结石、肝内胆管结石和肝胆管癌均甚常见，据认为与泰国的一种肝吸虫（廨猫后睾吸虫Opisthorchiasis）寄生虫有关。寄生虫所引起的胆道感染、慢性炎症改变、胆管上皮增生、肝胆管狭窄和异物留存等均给肝内胆管结石生成提供良好场所。
肝内胆管胆汁停滞是发生肝内胆管结石时的必需条件。胆汁停滞可能是某支肝管的胆汁流动减慢，当胆管发生完全性梗阻，胆汁己经停止分泌时，如在急性的胆管内高压或肝内胆管已变成无色的“白胆汁”(如见于恶性肿瘤的胆管梗塞)时，均不是产生肝内胆管结石的条件。因而肝内胆管结石是一个慢性的病理过程，伴有胆管的部分性梗阻胆流障碍和胆道内感染。
肝内胆管胆汁停滞的原因可由于肝胆管狭窄或结石的阻塞。肝内胆管结石并发肝胆管狭窄者甚为常见。其发生部位多在肝门部胆管和Ⅰ、Ⅱ级肝管。
肝内结石的形成与胆道慢性炎症、细菌感染、胆道蛔虫、胆汁瘀滞、营养不良等因素有关。胆管内慢性炎症是导致结石形成的重要因素，胆汁瘀滞是结石形成的必要条件。
肝内胆管结石的类型
弥漫型
即结石可自肝外胆管向上堆积，直至几乎充满整个肝内胆管系统。
散在型
少数的结石散布于肝胆管的某些分支内，特别常见于两个肝内胆管的汇合处之上，该处管腔较为膨大，结石可能存留于该部不易下降。
区域型
常生于有结石梗阻或肝胆管狭窄的基础上，引流该部分肝组织的肝胆管属支均充满结石，因而结石分布的范围可呈肝叶、肝段或半肝的区域性分布。
肝内胆管结石临床有何表现
肝胆管结石病的基本临床表现可分为三大类型，即静止型、梗阻型、胆管炎型，不同的类型有其不同的症状和体征。
急性胆管炎型主要表现为上腹部疼痛、寒战、发热以及*疸，可表现为多次反复发作。
单纯肝内胆管结石常无典型的胆绞痛，可表现为持续隐痛以及胀痛，可以牵涉到肩背部。
双侧肝内胆管结石或者合并肝外胆管结石可有长期持续性*疸但无明显的发热、腹痛、寒战表现。
若结石局限于一侧肝叶内可无*疸，若两侧肝均有结石，可因结石位置不同而其症状也不相同，通常位于左右肝管汇合部或者左右肝段主干等，*疸表现明显。
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